由于生殖系统的自身免疫或同种免疫所引起的不孕称免疫性不孕。如精子、精浆，卵透明带及卵巢内产生甾体激素的细胞均为特异性抗原，可引起免疫反应而产生相应的抗体，阻碍精子与卵子结合及着床而致不孕。
（1）精子免疫，可分为精子自身免疫和精子对女子产生的同种免疫，在正常情况下，虽精子具有抗原作用，但自身并不产生抗精子抗体。在输精管结扎。睾丸损伤等异常情况下外溢时，则可产生抗精子抗体。精子对女子产生同种免疫而致不孕的机理，一般认为是通过生殖道局部免疫的途径。女性生殖道特别是子宫，富有吞噬细胞，可识别并吞噬精子。由于生殖道粘膜渗透性的改变，增强了抗原吸收，若抗原不进入血液循环，则血清中不出现抗体或抗体效价偏低，进入生殖道的精子抗原可使生殖道局部的抗精子抗体浓度升高，故精子与抗精子抗体反应而精子失去活力导致不孕。
（2）卵透明带反应，卵透明带的特异性抗原，而血清中存在有特异的透明带自身抗体，它与透明带起反应后，可防止精子附着及穿透卵子而阻止受精，或防止受精卵从透明带逸出而阻断着床，引起不孕。
（3），很多原因不明的不孕妇女实属免疫性不孕，生殖道感染、损伤、手术以及促排卵药的应用等都可释放卵巢抗原或使其表达异常，加之机体免疫应答失调，可诱发免疫系统对特异性抗原致敏，产生针对自身卵巢组织的抗体，卵巢自身的抗体对生殖的影响是多方面的，其一：抗体与卵细胞结合通过補体依赖的细胞作用损伤卵细胞或妨碍卵细胞从卵泡排出。其二：抗透明带抗体可掩盖精子识别部位，阻碍精子粘附穿透，还能干扰受精卵自透明带逸出和着床。以上各种免疫性不孕，一但确诊，应及时应用免疫抑制剂或中药消除抗体，再同时应用促排卵药治疗，可重建患者卵巢功能，早日恢复正常月经及改善生育功能以增加妊娠机会。
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